Вода в скважине может иметь очень неприятный и характерный резкий запах, который напоминает тухлые яйца, может мутнеть, если такие признаки присутствуют, то с вероятностью 100%, концентрация сероводорода в данной воде очень высока и необходима очистка воды от сероводорода.
Это значит, что скважина немедленно должна быть оснащена специальными сооружениями для очищения воды от сероводорода. До того, как это будет выполнено, от употребления воды из источника необходимо воздержаться.

Сероводород содержащийся в воде, является результатом жизнедеятельности микроорганизмов. Такие микроорганизмы анаэробны, т.е. могут жить там, где нет кислорода. Такие бактерии превращают разные вещества, содержащие серу (в частности, сульфиты и сульфаты серы), находящиеся в воде, в сероводород в воде. Самыми подходящими местами обитания для них являются артезианские скважины и отложения ила на доньях колодцев.
Очистка от сероводорода воды из скважины возможна несколькими методами. Все способы подразделяются на 2 группы и подразумевают дезодорацию воды и нормализацию её химического состава:
Химические способы дают возможность достичь более полной дегазации. Основным фактором очищения, является окисление соединений, в которых, в свою очередь, содержится сероводород, или связывание этих соединений с другими веществами с переводом в их менее активную в воде форму. Третьим направлением являются процессы окисления и восстановительные процессы.

Преимущественно в РФ для очистки воды от сероводорода применяют хлор. При этом на 1 мг сероводорода необходимо 2,1 мг хлора. Такая реакция ведёт к появлению коллоидной серы, находящейся во взвешенной форме, объём которой примерно равен объёму сероводорода или гидросульфитов. При повышении дозы хлора до уровня 8,4 мг на каждый мг сероводорода в результате реакции образуются сульфаты.
Образующуюся вследствие реакции серу удаляют посредством фильтрования и применения коагуляции.
Неприятные запахи, образующиеся после процессов хлорирования и аэрации, удаляют путём фильтрования через активированный уголь. В некоторых случаях для очищения воды применяют двуокись хлора. Этот вариант имеет смысл в случае низкого содержания сероводорода, когда рН находится в диапазоне от 6,8 до 8,5.
Аэрирование дает возможность удалить молекулярный сероводород, также в очень ограниченном количестве. Полное удаление сероводорода является возможным только после подкисления воды, которое является вспомогательным элементом в уменьшении уровня pH ниже пяти единиц. В свою очередь, это ведёт к подавлению ионами водорода диссоциации сероводорода и к переходу его к молекулярной форме.

Применение аэраторов разной конструкции, очищающих сероводород в питьевой воде, даёт возможность устранить около 70 процентов всего сероводорода, который присутствует в очищаемой воде в растворенном виде. Основным условием в данном случае является требование, предусматривающее оптимальное количество воздуха, который подаётся через аэратор. При соприкосновении с воздухом во время аэрации вода, которая содержит сероводород, оказывается в условиях, в которых содержание сероводорода в воде, а также его растворимость, являются ничтожно низкими.

В большинстве случаев в качестве адсорбента применяется активированный уголь. Иногда они сочетаются с окислителями, вследствие чего снижается необходимое содержание сорбентов. Осуществление процесса адсорбции напрямую определяется структурой применяемого угля, концентрацией сероводорода в очищаемой воде, а также структурой окислов, которые образуются на угле. Этот метод подразумевает применение угольных открытых либо напорных фильтров с предварительным введением окислителя в очищаемую воду.